农业园区规划设计中应坚持生态优先的原则，妥善解决在农业园区建设和运营后所带来的环境破坏和污染，在具体的规划与开发中务必采取必要的措施和技术，按建设资源节约型、环境友好型社会的要求，把保护和优化生态环境放在首位，创造人与自然相和谐的生产、生活、休闲环境景观和空间，确保农业园区生态可持续发展，功能区的设计和项目的取舍。
    农业园区是以农业技术创新为重点，以高科技、高转化为特征，融现代工程设施体系、高新技术体系和经营管理体系于一体，在实现社会效益、生态效益的基础上，突出经济效益，充分发挥园区的资源优势和区位优势，利用已有的农业科技优势、农业区域优势和自然社会资源优势，立足于本地资源开发和主导产业发展的需求，按照现代农业产业化生产和经营体系配置要素和科学管理，在特定地域范围内建立起的科技先导型现代农业示范基地。
    在进行农业园区规划时要合理规划，稳步推进。远景设计研究院农业园区规划专家谈到:一方面充分考虑自然生态的可持续性，严格保护生态资源，防止环境被污染和破坏，同时改善生产条件，保护生态环境，实现资源的可持续利用，确保园区农业的经济效益、社会效益和生态效益的高度统一，实现农业园区内环境资源的可持续发展;另一方面，在项目设计上逐步形成具有自我发展、自我提高的良性机制，使农业园区能够持续健康地向前发展。